Biotech IT化?這家公司想讓生物工程改造像軟件開(kāi)發(fā)一樣簡(jiǎn)單高效
一個(gè)月前,以“Link Start”為主題、以“Unconference自組織會(huì)議”為主要活動(dòng)形式的Synbiopunk2021暨生物開(kāi)發(fā)者大會(huì)在上海創(chuàng)智天地落下帷幕。大會(huì)創(chuàng)新的形式與主題吸引了各界人士前來(lái)參與,包括來(lái)自藍(lán)晶微生物、華恒生物、亞馬遜云科技等企業(yè)界的創(chuàng)始人/高管
一個(gè)月前,以“Link Start”為主題、以“Unconference自組織會(huì)議”為主要活動(dòng)形式的Synbiopunk2021暨生物開(kāi)發(fā)者大會(huì)在上海創(chuàng)智天地落下帷幕。大會(huì)創(chuàng)新的形式與主題吸引了各界人士前來(lái)參與,包括來(lái)自藍(lán)晶微生物、華恒生物、亞馬遜云科技等企業(yè)界的創(chuàng)始人/高管,來(lái)自紅杉資本、五源資本、至臨資本等知名投資機(jī)構(gòu)的投資人士以及來(lái)自北大、復(fù)旦等高校的學(xué)術(shù)領(lǐng)袖。
值得注意的是,這場(chǎng)思想盛宴的背后發(fā)起者及主辦方是一支非常年輕的團(tuán)隊(duì)——小熊貓生物(深圳尋竹生物科技有限公司,英文名“Ailurus Biotechnology”)。這是一支怎樣的團(tuán)隊(duì)?為什么選擇發(fā)起Synbiopunk系列大會(huì)活動(dòng)?該公司的成員又是怎樣的背景,能夠在本次大會(huì)上邀請(qǐng)到如此多的重磅嘉賓?Synbiopunk系列會(huì)議的舉辦,對(duì)于整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈的發(fā)展有什么樣的推動(dòng)作用?
為了探尋以上問(wèn)題的答案,動(dòng)脈網(wǎng)對(duì)小熊貓生物創(chuàng)始人兼CEO郭昊天博士進(jìn)行了專訪。
(欲了解大會(huì)相關(guān)的更多精彩內(nèi)容,請(qǐng)點(diǎn)擊閱讀動(dòng)脈網(wǎng)現(xiàn)場(chǎng)報(bào)道文章:《一場(chǎng)屬于“生物開(kāi)發(fā)者”的狂歡——Synbiopunk2021暨生物開(kāi)發(fā)者大會(huì)于10月9-10日在上海舉行》。)
Biotech“IT”化:讓生物工程改造像軟件開(kāi)發(fā)一樣簡(jiǎn)單高效
早在小熊貓生物創(chuàng)立剛四個(gè)月的時(shí)候,郭昊天博士在其題為《合成生物學(xué)未來(lái)廿年:無(wú)盡的創(chuàng)造》的文章闡述過(guò)自己對(duì)合成生物學(xué)未來(lái)二十年發(fā)展的一些思考,“在合成生物學(xué)的早期,我們常用各種計(jì)算機(jī)和電子工程的比喻和類比去指導(dǎo)合成生物學(xué)的發(fā)展,因此,過(guò)去20年來(lái)的合成生物學(xué)設(shè)計(jì)方法是基于布爾代數(shù)的,基于可替換標(biāo)準(zhǔn)元件的。但歸根到底,生物系統(tǒng)和晶體管還是兩種截然不同的物質(zhì)。我們需要全新的思路,去設(shè)計(jì)未來(lái)的生物工程語(yǔ)言和方法論,這將使合成生物學(xué)產(chǎn)生質(zhì)的蛻變。”
如何設(shè)計(jì)未來(lái)的生物工程語(yǔ)言和方法論,小熊貓生物有自己的答案——在合成生物學(xué)這片充滿想象力的土地,建立生物產(chǎn)品設(shè)計(jì)的“標(biāo)準(zhǔn)語(yǔ)言”,并提供給用戶各種工具和云服務(wù)的接口。小熊貓生物基于“超大規(guī)模并行實(shí)驗(yàn)”搭建的合成生物學(xué)研發(fā)平臺(tái)能夠讓實(shí)驗(yàn)通量實(shí)現(xiàn)百萬(wàn)倍起步的提升,用于快速迭代生物產(chǎn)品,讓生物工程改造能像軟件開(kāi)發(fā)一樣簡(jiǎn)單高效。
這聽(tīng)起來(lái)似乎有點(diǎn)難以想象。但“出生”才剛滿一歲的小熊貓生物,已經(jīng)交出了第一份“答卷”。今年6月,小熊貓生物推出了首個(gè)超高通量云端載體測(cè)試平臺(tái)——Ailurus vec?,該平臺(tái)提供超高通量、超低價(jià)格的載體測(cè)試實(shí)驗(yàn)用于蛋白表達(dá)優(yōu)化,幫助科研及產(chǎn)業(yè)界解決普遍面臨的蛋白質(zhì)表達(dá)難題。
“關(guān)于蛋白重組表達(dá),為便于學(xué)生理解,教科書上向我們做了這樣的簡(jiǎn)化:一個(gè)目的基因片段,一個(gè)載體,完美地銜接在一起,然后導(dǎo)入底盤細(xì)胞,似乎就能非常順利地表達(dá)出我們想要的目標(biāo)蛋白質(zhì)。然而事實(shí)并不是這樣。”
郭昊天博士表示,在實(shí)際的工作過(guò)程中,大量的目的基因在重組之后,其實(shí)并不能順利在細(xì)胞里面合成蛋白質(zhì)。合成的蛋白質(zhì)產(chǎn)量低、沒(méi)有活性等各種奇奇怪怪的情況都可能發(fā)生。而這些問(wèn)題至今依舊沒(méi)有一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的解決方案,很多實(shí)驗(yàn)室沿用著從前輩那里傳下的經(jīng)驗(yàn),或多或少會(huì)帶著點(diǎn)“玄學(xué)”的味道,并且也難以保證最終的成功。歸根究底,影響蛋白質(zhì)成功表達(dá)的因素眾多,而蛋白表達(dá)載體的選擇無(wú)疑是最關(guān)鍵的一個(gè)。
“大量的系統(tǒng)與合成生物學(xué)工作已經(jīng)證明不同的蛋白質(zhì)表達(dá)需要差異化的載體環(huán)境。目前,蛋白質(zhì)表達(dá)的商用載體可選擇的范圍很小,全世界范圍可能也只有幾十種,且很多是二三十年前發(fā)明之后就再?zèng)]更新過(guò)的。此外,在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行載體測(cè)試的成本也比較高,單個(gè)載體的測(cè)試成本大概在200-1000元不等。”瞄準(zhǔn)這樣的市場(chǎng)痛點(diǎn),小熊貓生物推出了首個(gè)超高通量云端載體測(cè)試平臺(tái)——Ailurus vec?。
Ailurus vec?是一個(gè)自動(dòng)化的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),用戶只需選擇待測(cè)蛋白質(zhì)序列和實(shí)驗(yàn)條件,就可以對(duì)不同載體進(jìn)行超高通量的蛋白表達(dá)鑒定,從而獲得更優(yōu)的蛋白表達(dá)方案。相比典型的實(shí)驗(yàn)室工作,該平臺(tái)無(wú)需重復(fù)冗長(zhǎng)的試錯(cuò)過(guò)程即可為蛋白質(zhì)表達(dá)尋求到最適載體,大大降低了開(kāi)發(fā)成本并提升研發(fā)速度。
郭昊天博士表示,相比市場(chǎng)上僅能選用的幾十種商用載體,小熊貓生物的載體庫(kù)囊括了1000億+種載體DNA,且海量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)正在驅(qū)動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí)模型不斷設(shè)計(jì)新的載體序列。總體來(lái)講,其選擇空間比傳統(tǒng)規(guī)模要大上10個(gè)數(shù)量級(jí)。而在價(jià)格方面,Ailurus vec?一個(gè)實(shí)驗(yàn)通量的測(cè)試可以低至5.2元人民幣,遠(yuǎn)低于傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室中的測(cè)試成本。這是效率和性價(jià)比的雙重提升。就在昨天,美國(guó)合成生物學(xué)平臺(tái)龍頭企業(yè)Ginkgo Bioworks也緊隨其后發(fā)布了蛋白表達(dá)的細(xì)胞開(kāi)發(fā)套件(CDK),但目前僅包括10萬(wàn)種載體系統(tǒng),需要一年的交付周期,起步價(jià)格為10萬(wàn)美元。相比上一代以生物鑄造廠為核心的平臺(tái)型公司,小熊貓生物已經(jīng)展現(xiàn)了更加卓越的技術(shù)和產(chǎn)品能力。
自首款產(chǎn)品上線以來(lái),小熊貓生物陸續(xù)接到了清華大學(xué)、上海科技大學(xué)等國(guó)內(nèi)一流高校實(shí)驗(yàn)室的付費(fèi)訂單,同時(shí)也為國(guó)際遺傳工程機(jī)器(iGEM)大賽、國(guó)際定向進(jìn)化大賽(iDEC)的多支比賽隊(duì)伍提供了免費(fèi)的測(cè)試服務(wù),僅10月就交付了20萬(wàn)個(gè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),市場(chǎng)反饋不錯(cuò)。未來(lái),小熊貓生物希望按照目前的商業(yè)發(fā)展模式繼續(xù)前行,通過(guò)挖掘、判斷行業(yè)的共性需求點(diǎn),不斷地研發(fā)推出新的標(biāo)準(zhǔn)化平臺(tái)產(chǎn)品。
年輕的團(tuán)隊(duì),樂(lè)于“突破常規(guī)”,尋找“更優(yōu)解”
小熊貓生物的創(chuàng)始團(tuán)隊(duì),是一群具備交叉學(xué)科背景的“90后”青年科學(xué)家。在奇績(jī)創(chuàng)壇2020年的秋季創(chuàng)業(yè)營(yíng)中,小熊貓生物團(tuán)隊(duì)是所有團(tuán)隊(duì)中創(chuàng)始人平均年齡最小的。
【編者注:奇績(jī)創(chuàng)壇由陸奇博士(前百度總裁兼 COO、微軟執(zhí)行副總裁、雅虎執(zhí)行副總裁)于2018年創(chuàng)立,前身是YC中國(guó)(YC是全球頂尖的早期投資加速機(jī)構(gòu)),主要專注于早期技術(shù)驅(qū)動(dòng)型項(xiàng)目的投資、加速和創(chuàng)業(yè)者社區(qū)建設(shè)。】
小熊貓生物創(chuàng)始人兼CEO郭昊天,畢業(yè)于巴黎交叉科學(xué)研究院(CRI)前沿生物學(xué)專業(yè),獲巴黎大學(xué)博士學(xué)位。郭昊天博士期間以瑪麗居里學(xué)者身份,工作于系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)源地之一——TaMaRa's Lab。實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)始人Miroslav Radman是歐洲科學(xué)院、法國(guó)科學(xué)院、美國(guó)科學(xué)院、美國(guó)人文與科學(xué)院院士,其發(fā)現(xiàn)并命名的“SOS”反應(yīng),開(kāi)創(chuàng)了DNA損傷修復(fù)領(lǐng)域的先河。其博士導(dǎo)師Lindner教授是細(xì)菌衰老學(xué)的開(kāi)創(chuàng)者,也是歐洲最早的合成生物學(xué)科學(xué)家之一,其發(fā)表于2010年《科學(xué)》封面的合成RNA腳手架技術(shù),目前被廣泛地應(yīng)用在了CRISPR、代謝工程等多個(gè)下游領(lǐng)域。此前,郭昊天碩士期間于麻省理工學(xué)院(MIT)物理系研究微生物種群動(dòng)力學(xué),本科畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)專業(yè)。目前郭昊天還兼任清華大學(xué)錢學(xué)森班暨深圳零一學(xué)院菁銳導(dǎo)師。
公司聯(lián)合創(chuàng)始人兼COO江山年僅21歲,本科就讀于愛(ài)丁堡大學(xué),在愛(ài)丁堡大學(xué)合成生物學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)中心跟隨Teuta Pilizota教授研究生物物理與細(xì)菌生理。江山的合成生物學(xué)生涯始于高中時(shí)代,在中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所師從所長(zhǎng)劉陳立研究員。2020年,江山與朋友創(chuàng)立了國(guó)際定向進(jìn)化大賽(iDEC),也曾是國(guó)際遺傳工程機(jī)器(iGEM)大賽工程委員會(huì)的成員。
同大多數(shù)合成生物學(xué)初創(chuàng)企業(yè)的創(chuàng)始成員一樣,兩位創(chuàng)始人結(jié)緣于國(guó)際遺傳工程機(jī)器(iGEM)大賽。郭昊天博士自2017年至今擔(dān)任iGEM大賽的評(píng)委;江山曾帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)奪得2018年iGEM大賽總冠軍(Grand Prize),是中國(guó)地區(qū)iGEM大賽交流社群(目前國(guó)內(nèi)合成生物學(xué)最大交流社群)CCiC(Conference of China iGEMer Community)的主席(2019-2020)。2020年,剛博士畢業(yè)的郭昊天懷著將技術(shù)成果轉(zhuǎn)化為落地產(chǎn)品的熱忱,在歸國(guó)期間碰到了同樣有創(chuàng)業(yè)意愿的江山。兩位因iGEM結(jié)識(shí)并相交多年的好友一拍即合,以更加積極開(kāi)放的思維模式與更加靈活高效的執(zhí)行策略開(kāi)始了這段創(chuàng)業(yè)之旅。
“我們追求簡(jiǎn)單而優(yōu)美的東西,也相信所有事情總是會(huì)有一個(gè)更加高效的解決方案。”郭昊天博士說(shuō)道。他們?cè)谧巫我郧髥?wèn)題的“更優(yōu)解”。不論是A. vec 的研發(fā)過(guò)程,還是Synbiopunk會(huì)議模式的選擇,所有的決策不僅體現(xiàn)著這個(gè)團(tuán)隊(duì)知識(shí)與經(jīng)驗(yàn)的積累,也展現(xiàn)出他們勇于打破常規(guī)、不斷追求突破的態(tài)度。
“我們非常鼓勵(lì)我們團(tuán)隊(duì)內(nèi)部的人‘打破常規(guī)’,去實(shí)現(xiàn)一些‘瘋狂’的想法,以不斷尋求新的突破。”郭昊天博士表示,小熊貓創(chuàng)立的初衷是從源頭推動(dòng)創(chuàng)新,需要大家有足夠的創(chuàng)造力,在技術(shù)的支持下去高效完成產(chǎn)品的設(shè)計(jì)以及迭代。同時(shí),也因?yàn)槠脚_(tái)本身的賦能所在,研發(fā)人員做實(shí)驗(yàn)的試錯(cuò)成本相對(duì)較低,有能力允許大家犯錯(cuò)。
總的來(lái)說(shuō),公司的文化氛圍、價(jià)值觀與公司的商業(yè)發(fā)展模式是相契合的。“‘打破常規(guī)’的行為并不是刻意而為,更多的是我們團(tuán)隊(duì)抓住底層邏輯、深思熟慮后的結(jié)果。”
定位平臺(tái)型企業(yè),促進(jìn)行業(yè)快速發(fā)展
關(guān)于什么是平臺(tái)型公司,小熊貓生物團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,正如Bill Gates所說(shuō),一個(gè)平臺(tái)應(yīng)該讓使用這個(gè)平臺(tái)的所有用戶,創(chuàng)造出超過(guò)平臺(tái)公司本身的價(jià)值。在合成生物學(xué)產(chǎn)業(yè)鏈中,平臺(tái)型公司作為產(chǎn)業(yè)鏈的上游節(jié)點(diǎn),主要在設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和供應(yīng)等環(huán)節(jié)為傳統(tǒng)生物企業(yè)提供各類工具支持與技術(shù)服務(wù)。“實(shí)驗(yàn)室里的一線開(kāi)發(fā)者可以利用這些工具和服務(wù)去幫助他們加快研發(fā)速度、降低成本和減少重復(fù)性勞動(dòng)。”郭昊天博士表示。
無(wú)論是正在打造的一系列超高通量實(shí)驗(yàn)平臺(tái),還是此次舉的辦Synbiopunk生物開(kāi)發(fā)者大會(huì)這樣的交流平臺(tái),小熊貓生物希望讓未來(lái)所有的生物產(chǎn)品設(shè)計(jì)可以通過(guò)自身的平臺(tái)接入整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈條,讓產(chǎn)品和平臺(tái)共同推動(dòng)整個(gè)行業(yè)快速發(fā)展。“一家企業(yè)或者研究機(jī)構(gòu)能做的事情是有限的,一個(gè)龐大的產(chǎn)業(yè)生態(tài)的效率相比單獨(dú)的企業(yè)會(huì)有質(zhì)的提高。”郭昊天博士說(shuō)道。
從平臺(tái)型企業(yè)的市場(chǎng)前景看,在2021年上市的兩家平臺(tái)型代表企業(yè),合成生物學(xué)服務(wù)平臺(tái)Ginkgo Bioworks與基因組數(shù)據(jù)分析平臺(tái)NRGene,目前的市值已經(jīng)分別達(dá)到260億和190億美元。定位平臺(tái)型合成生物學(xué)企業(yè)的小熊貓生物,后續(xù)將怎樣為我們描畫Biotech“IT化”的理想藍(lán)圖?我們拭目以待。
本文來(lái)源:動(dòng)脈網(wǎng) 作者:小編 免責(zé)聲明:該文章版權(quán)歸原作者所有,僅代表作者觀點(diǎn),轉(zhuǎn)載目的在于傳遞更多信息,并不代表“醫(yī)藥行”認(rèn)同其觀點(diǎn)和對(duì)其真實(shí)性負(fù)責(zé)。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)和其他問(wèn)題,請(qǐng)?jiān)?0日內(nèi)與我們聯(lián)系